[1] 国家自然科学基金重点项目，《基于网络模型的癌症相关模式挖掘理论与方法》，2016/01-

2020/12，290万元。（项目负责人：高琳）

[2] 国家自然科学基金重点项目，《基于高通量RNA-seq数据转录组拼接的关键技术与算法研究》，2015/01-2019/12，280万元。（项目负责人：高琳）

[3] 国家重点研发计划重点专项，《精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发》，2018/07-2020/12。（项目负责人：高琳）

[4] 国家自然科学基金重大研究计划培育项目，《完整糖肽上N-连接糖链结构的从头测序新技术研究》，2019/01-2021/12。（项目负责人：张军英）

[5] 国家自然科学基金重大研究计划，《基于非编码RNA调控网络的复杂疾病致病模式发现研究》，2016/01-2016/12，25万元。（项目负责人：高琳）

[6] 国家自然科学基金重大研究计划，《复杂疾病恶化过程相关模式发现理论与方法研究》，2012/01-2014/12，75万元。（项目负责人：高琳）

[7] 国家自然科学基金重点项目，《生物网络数据分析与挖掘中相关理论与关键技术》，2010/01-2013/12。（项目负责人：高琳）

[8] 国家自然科学基金面上项目，《三维基因组结构模式挖掘方法研究》，2019/01-2022/12，66万元。（项目负责人：高琳）

[9] 国家自然科学基金面上项目，《基于组织多层网络模型的药物重定位方法研究》，2017/01-2020/12，63万元。（项目负责人：鱼亮）

[10] 国家自然科学基金面上项目，《基于新一代测序数据的肿瘤纯度及倍体动态预测方法研究》，2016/01-2019/12，60万元。（项目负责人：袁细国）

[11] 国家自然科学基金面上项目，《长非编码RNA与复杂疾病关联异常模式挖掘方法研究》，2017/01-2020/12，62万元。（项目负责人：郭杏莉）

[12] 国家自然科学基金面上项目，《复杂疾病的结构化组织规律发现方法研究》，2018/01-2021/12，63万元。（项目负责人：王炳波）

[13] 国家自然科学基金面上项目，《混响环境下双耳声源定位的研究及应用》，2017/01-2020/12。（项目负责人：张军英）

[14] 国家自然科学基金面上项目，《集成化高精度脑电信号读取与特征提取技术研究》，2020/01-2023/12，59万元。（项目负责人：杨利英）

[15] 国家自然科学基金青年科学基金项目，《生物序列大数据集模体发现算法的研究》，2016/01-2018/12，21万元。（项目负责人：于强）

[16] 国家自然科学基金青年科学基金项目，《基于分子互作网络的癌症驱动突变识别方法研究》，2018/01-2020/12，29万元。（项目负责人：黄晓太）

[17] 国家自然科学基金青年科学基金项目，《基于图论的复杂网络高阶组织结构挖掘算法研究》，2018/01-2020/12，29万元。（项目负责人：贾松卫）

[18] 国家自然科学基金青年科学基金项目，《基于蛋白质相互作用网络的疾病模块挖掘》，2013/01-2015/12，23万元。（项目负责人：鱼亮）

[19] 国家自然科学基金青年科学基金项目，《癌症体细胞拷贝数变异功能模式的鉴定方法与应用研究》，2013/01-2015/12，25万元。（项目负责人：袁细国）

[20] 国家自然科学基金青年科学基金项目，《长非编码RNA功能预测网络模型与算法研究》，2014/01-2016/12，28万元。（项目负责人：郭杏莉）

[21] 国家自然科学基金青年科学基金项目，《动态生物分子网络演化模式挖掘算法研究》，2012/01-2014/12，24万元。（项目负责人：覃桂敏）

[22] 陕西省自然科学基金项目，《药物靶标预测及药物重新定位方法研究》，2016/01-2017/12。（项目负责人：鱼亮）

[23] 陕西省自然科学基金项目，《恐怖分子网络中高阶组织结构的挖掘及其在精准反恐中的应用研究》，2019/01-2020/12。（项目负责人：贾松卫）

[24] 陕西省自然科学基金项目，《基于生物大数据的癌症分子标记物识别方法》，2017/01-2018/12。（项目负责人：覃桂敏）

[25] 中国博士后基金面上项目，《基于人类基因功能互作网络的癌症驱动基因的识别》，（一等资助），2017/01-2018/12。（项目负责人：黄晓太）

[26] 中国博士后基金面上项目，《基于结构化分析的复杂网络社团功能研究》，2017/01-2018/12。（项目负责人：贾松卫）

[27] 陕西省博士后基金项目，《社交网络节点结构影响力在精准反恐中的应用》，2018/01-2019/12。（项目负责人：贾松卫）

[28] 陕西省自然科学基础研究计划项目，《基于新一代测序数据的体细胞拷贝数变异显著性检测》，2016/06-2018/06。（项目负责人：袁细国）

[29] 西安电子科技大学基本科研业务费应急项目，《基于药物重定位预测新型冠状病毒（2019-nCoV）肺炎潜在治疗药物》，2020/02-2020/05。（项目负责人：鱼亮）

[30] 西安电子科技大学基本科研业务费应急项目，《基于深度学习的新型冠状病毒肺炎患者快速筛查系统》，2020/02-2020/05。（项目负责人：袁细国）

[31] 横向科研项目，《智慧健康医养大数据平台前期规划》，2019/10-2020/12。（项目负责人：袁细国）

[32] 河南子阳科教设备有限公司（横向项目），《移动机器人科研平台软件技术开发》，2019/09-2021/09。（项目负责人：张军英）